Examinando por Materia "Heritability"

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Estimación de la heredabilidad de seis caracteres de calidad de fibra de alpacas huacaya del INIA Puno
(Göttingen University Press, 2019-07-02) Mamani Cato, Rubén Hebert; Huanca Mamani, Tedosio; Pineda Serruto, Martín Equicio; Naveros Flores, Mary Luz; Gallegos, R.
El objetivo fue estimar las heredabilidades de seis caracteres de calidad de fibra de alpacas Huacaya a la primera esquila del banco de germoplasma del Instituto Nacional de Innovación Agraria, ubicado en el departamento de puno a una altitud de 4,200 metros en la zona agroecológica de puna seca. La base de datos constó de 9,114 registros de fibra y fueron analizados con el analizador óptico del diámetro de fibra (OFDA, IWTO-47-95) en el laboratorio de fibras del IVITA Maranganí. Para estimar los componentes de varianza del diámetro de fibra, desviación estándar del diámetro de fibra, factor de confort, coeficiente de variabilidad del diámetro de fibra, longitud de mecha y peso vellón se utilizó el modelo animal unicaracter y = Xb + Zu + e, donde y es el vector de observaciones, b es el vector de efectos fijos (sexo, color y mes-año de esquila) la edad en días se consideró como covariable lineal, u es el vector que representa el efecto genético aditivo, e es el vector de residuales; X y Z son las matrices de incidencia de efectos fijos y aleatorios respectivamente. Los componentes de varianza fueron estimados por el método de Máxima Verosimilitud Restringida (REML) utilizando el programa VCE versión 6.0.2. La heredabilidad estimada para el Diámetro de fibra fue de alta magnitud 0.540±0.087; para el resto de caracteres fue de media magnitud siendo para la Desviación estándar 0.311±0.089, Factor de confort 0.278±0.077, Coeficiente de variabilidad 0.291±0.089, Peso vellón 0.158±0.027 y Longitud de mecha 0.268±0.081. Se concluye que es posible obtener una buena respuesta a la selección para los seis caracteres de calidad de fibra en alpacas Huacaya.
Heredabilidad, correlaciones genéticas y fenotípicas de características de la fibra de alpacas Suri de un año de edad en el anexo Quimsachata del INIA – Puno
(Universidad Nacional del Altiplano. Escuela de Postgrado, 2022-09-30) Mamani Choque, Gerardo Godofredo
Los objetivos del presente estudio fueron estimar las heredabilidades, correlaciones genéticas y fenotípicas para caracteres asociados a la uniformidad del diámetro de fibra en el vellón de alpacas Suri de primera esquila, del Anexo Quimsachata del INIA Puno, ubicado en el Departamento de Puno, a 4190 m.s.n.m. en la Zona Agroecológica de Puna Seca. Se utilizaron muestras de 413 alpacas Suri de primera esquila, nacidas en los años 2013 hasta el año 2017. Los caracteres evaluados fueron el diámetro promedio de fibra (DF), coeficiente de variación del diámetro promedio de fibra (CV), factor de confort (FC), finura al hilado (FH), el índice de curvatura (IC) y la desviación estándar del diámetro promedio de fibra (DS). Para estimar los componentes de varianza delos caracteres mencionados se utilizó el modelo animal multicarácter. Los componentes de varianza y parámetros genéticos fueron estimados por el método de Máxima Verosimilitud Restringida y se utilizó el programa VCE. Las correlaciones fenotípicas se estimaron por el método de correlación de Pearson con el programa estadístico SAS. Los resultados muestran que las heredabilidades obtenidas para DF, CV, FC, FH, IC y DS, fueron: 0,69; 0,48; 0,59; 0,68; 0,14 y 0,61, respectivamente. Las correlaciones genéticasy fenotípicas fueron de baja, mediana y alta magnitud. Se concluye que las heredabilidades sugieren que la selección individual por estas características, menos por IC, resultarán en un progreso genético aceptable. Asimismo, seleccionando por estos caracteres se lograría reducir la variabilidad de la finura en los vellones. Asimismo, estimar y conocer los parámetros genéticos de todos estos caracteres permitirá tomar una decisión más acertada al momento de elegir los objetivos y criterios de selección dentro de un plan de mejora.
Hierarchical Bayesian modeling for comparing nonlinear functions and estimating heritability of growth curve parameters in llamas
(Elsevier B.V. en representación de KeAi Communications Co. Ltd., 2026-09-07) Canaza Cayo, Ali William; Mamani Cato, Ruben Herberht; Rodríguez Huanca, Francisco Halley; Churata Huacani, Roxana; Cardenas Minaya, Oscar Efrain; Huacani Pacori, Ferdynand Marcos; Calsin Cari, Maribel; Bueno Filho, Júlio Sílvio de Sousa
Genetic modeling of growth curve parameters in llamas is fundamental for breeding programs; however, previous studies have relied predominantly on two-stage frequentist approaches or conventional MCMC algorithms (Gibbs/Metropolis-Hastings), which present limitations regarding computational efficiency and simultaneous incorporation of multiple information sources. The objective of this study was to compare nonlinear functions (Brody, Gompertz, and von Bertalanffy) and jointly estimate growth curve parameters (asymptotic weight, A; scaling parameter, B; and maturation rate, k), variance components, and heritabilities in young llamas through hierarchical Bayesian modeling implemented with the No-U-Turn Sampler (NUTS) algorithm via Stan/brms. We analyzed 11,409 monthly weight records from birth to 365 days of age from 1000 llamas (456 males and 544 females) of K'ara and Ch'accu breeds from the Quimsachata Experimental Station (Peru). A three-stage hierarchical Bayesian model was adopted: (i) normal likelihood for weights conditioned on individual curves; (ii) multivariate animal model for parameters A, B, and k, including systematic effects (sex and breed) and additive genetic effects; and (iii) normal prior distributions for standard deviations. Posterior sampling (4000 post-warmup iterations) showed adequate convergence according to the Gelman-Rubin, Geweke, and Effective sample size diagnostics. The von Bertalanffy model was selected as the most parsimonious (Watanabe-Akaike Information Criterion (WAIC) = 20104.8; Leave-One-Out Information Criterion (LOOIC) = 27588). Estimated heritabilities for A were high (0.79 - 0.87), while those associated with parameters B and k were close to zero (0.007 – 0.075). We conclude that the hierarchical Bayesian approach with NUTS/brms is computationally efficient and statistically robust for analyzing growth curves in llamas, evidencing high genetic potential for adult weight selection, in contrast to the low heritability of curve shape parameters. This study represents the first application of the NUTS algorithm in hierarchical growth models for South American camelids.
Modelación de curvas de crecimiento y estimación de sus parámetros genéticos en alpacas (Vicugna pacos L.)
(Universidad Nacional Micaela Bastidas de Apurímac (UNAMBA), 2014-10-24) Mamani Cato, Rubén Hebert; Huanca Mamani, Teodosio; Gallegos, R. F.; Gutiérrez, J. P.
Los objetivos de este estudio fueron describir el crecimiento de alpacas jóvenes aplicando cuatro no lineales, además se evaluó el efecto ambiental sobre los parámetros de la curva de crecimiento; también se sintieron los parámetros genéticos de la curva de crecimiento y sus respectivos rasgos genéticos. Los datos fueron obtenidos de la estación experimental Quimsachata, (INIA) Perú. Para describir la trayectoria de crecimiento de los animales se aplicaron cuatro modelos no lineales: Brody, Von Bertalanffy, logístico y Gompertz mediante el procedimiento NLIN de SAS. Para evaluar la influencia de los efectos fijos, tales como color, sexo, año de nacimiento y mes de nacimiento en los parámetros de la curva de crecimiento se ha analizado en un diseño completamente aleatorizado utilizando el programa SAS. Los componentes de (co)varianza y los parámetros genéticos se estimaron por el método de Máxima Verosimilitud Restringida utilizando el programa VCE versión 5.0. Los valores de reproducción se estimaron utilizando el programa PEST versión 4.1. Se concluye que el modelo de crecimiento de Brody es adecuado para describir la curva de crecimiento en alpacas jóvenes. Las heredabilidades para el peso corporal asintótico y la tasa de maduración fueron de magnitud media y baja. Sin embargo, a pesar de esto, el peso asintótico mostró una buena ganancia genética lo que no ocurre para que la tasa de maduración sea cero, sugiriendo que sería factible implementar un programa de selección para modificar la pendiente de la curva de crecimiento de las alpacas.
Phenotypic and agromorphological diversity reveals detailed information about accessions with productive potential for cotton (Gossypium barbadense L.) in northeastern Peru
(Plants, 2026-01-21) Cordova Sinarahua, Deyvis; Linares Huapaya, Susan Maribel; Manco Céspedes, Emma Imelda
Cotton (Gossypium barbadense L.) is a crop of great economic importance, as the superior quality of its fiber is highly valued worldwide. The objective of this research was to evaluate the agromorphological diversity of cotton germplasm using both qualitative and quantitative descriptors. A combination of univariate and multivariate statistical analyses was applied to identify promising accessions. The coefficients of variation (GCV and PCV) and high heritability estimates observed for descriptors such as the number of sympodial branches, fiber weight, and number of seeds per capsule confirm genetic control, ensuring the effectiveness of selection in future breeding programs. Correlation analysis revealed a strong positive relationship between lint yield and number of bolls per plant (0.893). Furthermore, principal component analysis indicated that accessions PER1010536, PER1010538, PER1010543, and PER1010547 were associated with high yield and early-maturity traits. Furthermore, multiple correspondence analysis and mixed data factor analysis demonstrated that the observed variability also depends on qualitative traits such as petal spot and bract color, supporting the concept of a complex genetic architecture. These findings provide a solid basis for the development of new cotton cultivars with improved productivity.
Phenotypic diversity and selection of promising accessions of Cucurbita spp. from Peruvian germplasm
(Springer Nature, 2026-07-27) Celestino Avelino, Doris; Morales Luis, Jhunior; Lazaro Justo, Nilton Yefre; García Gantu, Ricardo Noel; Cueva Carhuatanta, César Aldair; Marcelo Salvador, Mavel Nansi
The genus Cucurbita spp. is native to the Americas, and Peru is one of its main centers of diversity. This crop represents a strategic resource for food security due to its adaptability and nutritional value. The objective of this study was to evaluate phenotypic diversity and select promising accessions of Cucurbita spp. conserved in the INIA Germplasm Bank (Peru). A total of 107 accessions were characterized using agromorphological descriptors (18 qualitative and 15 quantitative). Genetic variability parameters, correlation analysis, and multivariate analysis were estimated. Fruit size-related traits, including fruit length, width, and weight, exhibited high broad-sense heritability (H2 > 60%), suggesting high potential for selection. Correlation analysis revealed significant positive associations between fruit size and seed traits, and negative associations with total soluble solids, suggesting a trade-off between fruit size and sugar concentration. Likewise, the earlier-maturing accessions tended to produce larger fruits and seeds. Principal component analysis (PCA) explained 65.9% of the total variation, indicating that diversity is determined by characteristics related to fruit size, internal structure, and seed traits. Cluster analysis classified the accessions into four phenotypically distinct clusters. A multi-criteria index allowed for the selection of promising accessions in different species, notably PER1011008, PER1003595, and PER1010999 in C. ficifolia; PER1010939, PER1003572, and PER1010934 in C. maxima; PER1003584, PER1010957, and PER1010973 in C. moschata; and PER1010982, PER1010985, and PER1010987 in C. pepo. These results highlight the high value of Peruvian Cucurbita germplasm as a source of genetic diversity and as a basis for the targeted selection of ideotypes with potential in plant breeding programs focused on productivity, quality, and diversification of uses.