Examinando por Autor "Castillo Carrillo, Pedro S."

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Caracterización molecular y filogenética del gen 18S ARNr del nemátodo entomopatógeno Heterorhabditis indica aislado en el norte de Perú
(Universidad Nacional de Tumes, 2025-06-29) Córdova Campos, José Stalyn; Riojas Gonzáles, Joel Michel; Castillo Carrillo, Pedro S.; Cornejo Hidalgo, Rosa Emelda; Mogollón Farias, César Augusto; Garcia Garcia, Segundo Melecio; Rosillo Urbina, Erwin Saúl; Ruiz Turpo, Yair Eusebio; Ruiz Polo, Archi Alejandro
La caracterización molecular y filogenética de especies de nematodos entomopatógenos (NEPs) permiten la diferenciación de genotipos circulantes así como el mapeo de su distribución geográfica. Además, de los genotipos más agresivos en la infección de insectos. El objetivo de este estudio fue realizar la caracterización molecular y filogenética del gen 18S del ARNr del nemátodo entomopatógeno Heterorhabditis indica aislado en el norte de Perú. Se analizaron 851 bases nitrogenadas de una secuencia consenso del gen 18S del ARNr de una cepa de H. indica, aislada de bosques de algarrobo ubicados en el norte del Perú, la cual ha demostrado actividad entomopatógena contra Galleria mellonella (polilla de la cera). La secuencia consenso fue sometida a un análisis de similitud mediante la herramienta BLAST del GenBank del NCBI, empleando como criterios de búsqueda un 90% de identidad y cobertura. Las secuencias con dichos criterios fueron sometidas a un alineamiento múltiple con la secuencia consenso utilizando el software MEGA v.11. Posteriormente, el alineamiento múltiple se insertó en el software DnaSP v.5 para su caracterización a nivel de variabilidad monomórfica y polimórfica, y así identificar y diferenciar haplotipos. En el alineamiento múltiple, se eliminaron 74 bases no alineadas en sus extremos, de las que quedaron 777 en las que se identificaron y excluyeron 10 huecos (gaps), obteniéndose una matriz final de 767 bases para la caracterización molecular y filogenética. En el análisis de similitud se identificaron 6 secuencias con identidad de 84,89% a 85,11% y coberturas de 92% a 99%. En la caracterización, se encontró 658 sitios conservados (monomórficos) y 109 mostraron variabilidad (polimórficos), lo cual representa posibles eventos mutacionales. Asimismo, se identificaron seis haplotipos distintos (Hap-1 a Hap-6), con un índice de diversidad haplotípica (Hd) de 0,9524, evidenciando que la secuencia consenso evaluada presentó un solo haplotipo (Hap-2) por lo que se le asignó un código de diferenciación genotípica (C05HI). En la filogenética, la secuencia se emparentó con una secuencia registrada en el GenBank (OK493747.1), formando un grupo monofilético. Se sugiere la ampliación de estudios de H. indica C05HI el cual puede ser encontrado en suelos de bosques de algarrobo en el norte de Perú. Así mismo, se recomienda que organismos estatales implementen en sus programas de capacitación, asistencia y/o control de plagas de la especie de nematodo analizada.
Interacción biológica de la entomofauna en Vigna unguiculata L. asociada a la temperatura y fases fenológicas en un sistema de cultivo orgánico
(Universidad Nacional de Tumbes, 2026-03-31) Villegas Navarro, Eduardo Josue; Castillo Carrillo, Pedro S.; Mogollón Farias, César Augusto; Garcia Garcia, Segundo Melecio; Vásquez Garcia, Cesar Alejandro; Luna Socola, Andy Josué; Purizaga Preciado, Jorge Luis; Ruiz Polo, Archi Alejandro; Cordova Campos, Jose Stalyn
Vigna unguiculata L. es un cultivo clave para la seguridad alimentaria, sin embargo, su rendimiento se ve afectado por plagas y agroquímicos que perjudican a insectos benéficos. Por ello, estudiar las asociaciones con factores bióticos y abióticos es importante, más aún en sistemas orgánicos. El presente estudio evaluó las interacciones biológicas en la entomofauna de V. unguiculata L. asociada a la temperatura y fases fenológicas en un sistema orgánico establecido en la EEA-Los Cedros del INIA-MIDAGRI (Perú), empleando semillas del cultivar vaina blanca. Se realizaron nueve evaluaciones fragmentadas en las fases vegetativa, de floración y reproductiva durante la fenología del cultivo por 45 días. El muestreo se efectuó en 20 plantas seleccionadas al azar, mediante red entomológica y aspirador manual. La identificación taxonómica se llevó a cabo con claves entomológicas, y los datos fueron analizados mediante pruebas de normalidad (Shapiro-Wilk), correlaciones de Spearman y frecuencias taxonómicas. Se registraron seis órdenes con especies como Toxomerus sp., Ocyptamus dimidiatus, Allograpta sp., Apis mellifera, Spodoptera eridania (polinizador), Zelus sp., Hippodamia convergens, Cycloneda sanguinea, Chrysoperla externa (depredador), especie de la familia Lygaeidae, Sibovia sp., Empoasca kraemeri (plaga), Rupela albina (migratorio y/o visitante), Digonogastra sp. (Parasitoide). Se observó que la entomofauna varió por etapa fenológica del cultivo, siendo Hymenoptera el orden más abundante, seguido de Hemiptera, Diptera y Coleoptera, mientras que Lepidoptera y Neuroptera fueron menos frecuentes. La temperatura promedio fue de 28,2 °C, sin correlaciones significativas con la abundancia de insectos. Se infiere que V. unguiculata L. manejado con un sistema orgánico favorece diversas interacciones biológicas, donde su fenología es un factor determinante en la dinámica de las especies de insectos, mostrando una influencia más significativa que la propia temperatura.
PCR-RFLP in silico del gen 18S rRNA como alternativa para la identificación de nematodos entomopatógenos
(Universidad Nacional de Tumbes, 2026-03-31) Ruiz Polo, Archi Alejandro; Rojas Gonzales, Joel Michel; Castillo Carrillo, Pedro S.; Mogollón Farias, César Augusto; Valladolid Ramos, Milton; Garcia Garcia, Segundo Melecio; Cornejo Hidalgo, Rosa Esmelda; Vasquez Garcia, Cesar Alejandro; Cordova Campos, Jose Stalyn
En países en vías de desarrollo, el acceso a tecnologías modernas para el control de plagas es restringido, lo que plantea la necesidad de innovar en métodos y/o técnicas alternativas que sean más accesibles. El objetivo del estudio fue determinar la PCR-RFLP in silico del gen 18S ARNr como técnica alternativa en la identificación de nemátodos entomopatógenos. Se evaluaron dos cepas purificadas de larvas adultas de nematodos entomopatógenos, a partir de las cuales se extrajo el ADN genómico. Posteriormente, se llevó a cabo la amplificación del gen 18S del ARNr mediante PCR convencional y una secuenciación de ADN por la tecnología de Sanger en doble cadena. Las secuencias obtenidas fueron alineadas con el software MEGA v.11 y se generaron secuencias consenso de aproximadamente 850 pares de bases. Luego, se utilizaron herramientas como BLAST para la asignación taxonómica de especies y Restriction Mapper v.3 para el análisis de sitios de restricción y simulación de digestión enzimática. Las cepas analizadas se identificaron como Heterorhabditis indica y Heterorhabditis bacteriophora. En Heterorhabditis indica se hallaron 26 sitios de restricción, seleccionando cuatro sitios según su posición media (MslI, NruI, Tsp45I y BseRI), que luego de digerirlos in silico, generaron fragmentos de ADN con longitudes distintas. Por otra parte, en Heterorhabditis bacteriophora, se halló el mismo número de sitios de restricción, se seleccionaron tres (BglII, FokI y BstXI) y al digerirlos se obtuvieron fragmentos de ADN con diferentes longitudes. Los fragmentos de ADN (RFLP) obtenidos permitieron diferenciar claramente ambas especies. Los resultados demuestran que la técnica PCR-RFLP In silico del gen 18S ARNr es una herramienta efectiva para la identificación taxonómica de nematodos entomopatógenos, ofreciendo una alternativa viable en contextos donde los recursos son limitados y el control biológico es una alternativa.