Examinando por Materia "Transcriptoma"

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Identificación de genes relacionados con la tolerancia a la sequía en 41 variedades de quinua (Chenopodium quinoa Willd)
(Universidad Nacional de Trujillo, 2020-02-16) Serna Chumbes, Manuel Fernando; Montenegro Cabrera, Juan Daniel; Cruz Hilacondo, Wilbert Eddy; Koc Sánchez, Gabriela Elena
El objetivo de la investigación fue identificar los genes relacionados con la tolerancia a la sequía en la quinua. Para ello, se evaluaron 41 variedades de Chenopodium quinoa Willd con seis repeticiones; en la etapa de floración, se seleccionaron al azar tres macetas/material, de cada variedad, para ser inducidas a sequía total por dos semanas, reanudándose el riego después de ese periodo, las otras tres fueron el control. A partir del día 27 después de la siembra, se midió el nivel de clorofila y se clasificó como tolerante o susceptible a la sequía, en función de su índice de contenido clorofila (ICC). Para la identificación de genes se tomaron muestras de hoja de tres variedades (Red head, Salcedo INIA y Kankolla 1). La Extracción del ARN se realizó usando el reactivo reagent® TRI y para el secuenciamiento de transcriptomas se utilizó la plataforma de Ilumina. Se identificaron 26 genes en las tres variedades de quinua, pero en las variedades tolerantes a la sequía; tres de ellos son regulados al alza ante la exposición a la sequía y cinco genes (AUR62037809, AUR62000271, AUR62037807, AUR62042825 AUR62009791) tienen un cambio en su patrón de expresión como consecuencia de la exposición a la sequía.
Manual de procedimientos para estudios de transcriptomas en quinua
(Instituto Nacional de Innovación Agraria, 2020-02-04) Serna Chumbes, Manuel Fernando
En los últimos años la producción de quinua peruana ha sido sostenida, pero los cambios climáticos que se vienen presentando y que se acrecentarán en un futuro, presenta la necesidad del desarrollo de nuevas variedades adaptadas a los nuevos escenarios climáticos. Gracias al avance de la genética y las últimas tecnologías de secuenciamiento ahora es posible secuenciar genomas en un corto tiempo, permitiendo conocer los patrones genéticos de una especie determinada e identificar los genes que se expresan o activan frente a una determinada respuesta. Se formuló el proyecto 117_PI, cuyas actividades desarrolladas permitieron generar protocolos y validar metodologías, los cuales son plasmados en esta publicación como una guía para estudios similares de transcriptómica en plantas.