Examinando por Materia "Polimorfismo"

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Análisis de diversidad genética de palma aceitera (Elaeis guineensis y Elaeis oleífera) en la región Ucayali usando marcadores microsatélitales
(INIA. Estación Experimental Agraria Pucallpa - Ucayali, 2018-09) Camacho Villalobos, Alina Alexandra; Serna Chumbes, Manuel Fernando; Flores Guillén, Héctor Hernán
En el presente estudio se analizó la diversidad genética de 83 individuos con 12 marcadores SSR, encontrándose 160 alelos en total, siendo los cebadores mEgCIR0353 y el mEgCIR0254 los que obtuvieron una mayor cantidad de alelos, 22 y 20 respectivamente.
Variabilidad genética de Peronospora variabilis Gäum. del sur del Perú
(Ministerio de Desarrollo Rural y Tierras (MDRyT), 2023-03-31) Manotupa Tupa, Michael Bryan; Estrada Zúniga, Rigoberto; Gonza Cusipuma, Victor Antonio
La quinua (Chenopodium quinoa Willd.) es un alimento excepcional que proporciona todos los aminoácidos esenciales, y se encuentra próximo a los estándares de la nutrición humana establecidos por la FAO (PROINPA, 2011) se puede encontrar quinuas de costa, valles interandinos, puna y altiplano (Estrada, 2013). Sin embargo, este cultivo se ve constantemente amenazado por factores bióticos como el mildiu ocasionado por Peronospora variabilis y es considerado como el patógeno más devastador en cultivares susceptibles (Danielsen & Ames, 2001), es un Oomiceto que pertenece al reino Chromista. Para mitigar los efectos negativos en la producción de quinua es de importancia conocer la diversidad y la dinámica poblacional del patógeno (Choi et al., 2010). Existen varias razones para presumir que existe una gran diversidad genética del patógeno, entre estas podemos mencionar que el hospedero tiene un alto nivel de diversidad, el patógeno se encuentra en zonas geográficas muy diversas y posee un ciclo sexual donde hay recombinación genética (Danielsen & Ames, 2001), por consiguiente, se planteó el objetivo de determinar la variabilidad genética de Peronospora variabilis en el sur del Perú. El material biológico empleado fue recolectado en campo de agricultores de cinco regiones del sur del Perú. El inóculo fue multiplicado utilizando hojas sueltas de quinua de la variedad Quillahuaman INIA en placas Petri con agar agua al 0.7% (p/v). Los esporangios producidos fueron cosechados utilizando agua destilada estéril a presión por un aspersor manual. Estos esporangios fueron utilizados para la extracción de ADN mediante el método del CTAB. Para determinar la diversidad genética, una región parcial de la subunidad 1 de la NADH Deshidrogenasa del genoma mitocondrial fue amplificada por PCR con los iniciadores NADH F1 (5’ CTGTGGCTTATTTTACTTTAG 3’) Y NADH R1 (5’ CAGCAGTATACAAAAACCAAC 3’) diseñado por Kroon et al. (2004). Posteriormente los productos amplificados fueron purificados y secuenciados por la tecnología Sanger de la compañía Macrogen (Seúl, Corea del Sur). Las secuencias fueron editadas y ensambladas mediante el software MEGA11 (Tamura et al., 2021). Se identificaron 3 posiciones polimórficas del tipo transición a diferencia de Göker et al. (2007) que identificó 5 posiciones de las cuales 4 son del tipo transversión y una transición en la misma especie. Se determinó 6 haplotipos, de los cuales el haplotipo H2 está presente en las cinco regiones en estudio a diferencia del haplotipo H3 que es exclusivo de la región Ayacucho y el haplotipo H5 y H6 son exclusivos de la región Apurimac. De manera similar Santos et al. (2020) identificó 6 haplotipos en Plasmopara viticola analizando el gen que codifica para la enzima Citocromo b. Del análisis molecular se determina que el 73% de la variabilidad genética está explicada por la variación dentro de cada región y el 27% de la variabilidad genética, lo explica la variación entre poblaciones. Estos valores son significativos basados en los valores del estimador ΦPT = 0.266 que es mayor a cero, lo que indica que si existe diferencia genética y proviene del interior de las poblaciones.
Variabilidad genética en cultivares de Musa spp. mediante ADN polimórfico amplificado aleatoriamente (RAPD)
(Universidad Nacional de Tumbes, 2025-06-30) Garcia Garcia, Segundo Melecio; Campaña Olaya, Jalmer Fidel; Mogollón Farias, César Augusto; Riojas Gonzales, Joel Michel; Rimanaycuna Ramirez, Jhon Henrry; Seminario Juárez, Karla Lucía; Ruiz Polo, Archi Alejandro; Córdova Campos, José Stalyn; Suarez Peña, Erick Antonio
El norte de Perú presenta condiciones abióticas favorables para la producción de banano. Sin embargo, la selección artificial ha generado cultivares que, en ocasiones, son difíciles de distinguir fenotípicamente, lo que limita la selección de especímenes con resistencia a plagas y alta calidad productiva. Por esta razón, se recurre al análisis del material genético para identificar los genotipos presentes. Como objetivo se determinó la variabilidad genética de 9 cultivares de Musa spp. mediante ADN polimórfico amplificado aleatoriamente (RAPD). Se seleccionó la tercera hoja de cada planta de banano perteneciente a un cultivar, y utilizando tijeras estériles, se extrajo una porción que luego se disectó en pequeñas secciones. Posteriormente, se procedió a la extracción de ADN genómico, seguida de una amplificación mediante PCR-RAPD utilizando los marcadores OPA-1, OPA-2, OPA-3, OPA-4, A-01, OPC-2 y OPC-15, con el fin de identificar la variabilidad genética a través polimorfismos. Finalmente, el análisis del número de bandas amplificadas, polimórficas y sus respectivos porcentajes se realizó mediante el software R-Studio con el que se obtuvo un dendrograma como producto. En los cultivares IC2, Valery, Montecristo, Cavendish Gigante, Red Dacca, Williams, Gran enano, Gros Michel y M. paradisiaca cv. Zapatito, se amplificaron un total de 76 bandas, de las cuales 41 fueron polimórficas. El dendrograma reveló una relación genética estrecha entre cinco cultivares (Gran Enano, Williams, Montecristo, IC2 y Valery) debido a la similitud en las bandas polimórficas. En cambio, los cultivares Gros Michel, Red Dacca y Zapatito presentaron una diferenciación genética significativa, sin agruparse, debido a la ausencia o mayor cantidad de bandas polimórficas en cada uno. La evidencia sugiere que en el norte del Perú existe una notable diversidad genética entre los cultivares de Musa spp., lo que representa un recurso estratégico para el mejoramiento genético. Por ello, se plantea la integración sistemática de herramientas moleculares en los procesos de selección y certificación, con el objetivo de potenciar la sostenibilidad y competitividad del cultivo en la región.