Examinando por Materia "Molecular characterization"

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Caracterización molecular de Heliconia sp. utilizando la técnica RAPD
(Centro de Preparación para la Ciencia y Tecnología, 2019-01-14) Gutierrez, Freddy; Ramirez, Roberson; Adrianzén Julca, Pedro Marcelino; Cobos, Marianela; Pinedo Freyre, Sergio Fernando; Imán Correa, Sixto Alfredo; Castro, Juan
Este trabajo se realizó entre los meses de Julio a Setiembre del 2010, con el objetivo de caracterizar molecularmente a la especie Heliconia sp. Utilizando el marcador molecular RAPD. Para esto, se realizó la purificación del ADN genómico de la especie en estudio obteniéndose buenos resultados en cuanto a la calidad y la cantidad del ADN purificado, el cual fue verificado con los métodos electroforético y espectrofotométrico, la cantidad de ADN obtenido en promedio fue de 92.8 ng/ μl, asimismo el ratio de calidad promedio fue de 2.2. Para la amplificación de los productos de la PCR se empleó el iniciador MT3R, obteniéndose mucho polimorfismo. Los productos de la PCR tuvieron tamaños de 750 pb hasta 2050 pb. En cuanto a la caracterización molecular, se realizó un dendograma (UPGMA) utilizando el programa estadístico NTSIS versión 2.0. Asimismo se obtuvo la formación de 2 grupos (clusters) y 2 fugas donde se observó la aparición de “aparentes duplicados” en algunos de ellos, es decir, que comparten el mismo patrón genético con un 100% de similitud. Además el valor de la heterocigosidad esperada fue de 0.14, valor relativamente bajo, posiblemente al tipo de reproducción que posee este género, el cual es la autogamica.
Native entomopathogenic nematodes from Peru control Spodoptera frugiperda, a major pest of Zea mays in the Peruvian Amazon
(MDPI, 2026-03-09) Fachin Ruiz, Grecia; Córdova Sinarahua, Deyvis; Romero Chávez, Lorena Estefani; Alvarado Ramírez, Jaime; Quesquen Lopez, Cesar; Flores García, Eybis; Koch Duarte, Christian; Cerna Mendoza , Agustín; Vásquez Bardales, Joel; Corazon Guivin, Mike
This study evaluated entomopathogenic nematodes (EPNs) isolated from a cacao agroforestry system in the Peruvian Amazon, focusing on their molecular characterization and efficacy against Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) larvae. Thirteen EPN isolates were obtained from 50 soil samples using the Galleria mellonella baiting technique. Mortality assays revealed significant differences among isolates at 24, 48, and 72 h, with isolates 11N-A4 and 8N-B1 being the most virulent, achieving maximum mortalities of 100% and 96.3% at 72 h, respectively. Median lethal time (LT50) values indicated rapid action of these isolates on G. mellonella larvae, with 33.3 h for 11N-A4 and 32.4 h for 8N-B1. Molecular identification using ITS, D2-D3 (LSU), and COI markers confirmed the isolates as Heterorhabditis sp. (11N-A4) and Heterorhabditis amazonensis (8N-B1). In bioassays with S. frugiperda larvae, both EPNs exhibited dose- and time-dependent mortality. H. amazonensis showed rapid action, reaching 100% mortality at the highest dose (60 IJs/larvae) within 48 h, whereas Heterorhabditis sp. displayed a gradual, sustained increase, attaining 91% mortality at 72 h. Median lethal dose (LD50) and LT50 values reflected the efficiency of both isolates, with Heterorhabditis sp. achieving lower LD50 at later stages and shorter LT50 at low-to-intermediate doses. These findings highlight the potential of Heterorhabditis sp. and H. amazonensis as effective biocontrol agents adapted to local conditions and represent the first report of H. amazonensis in Peru. Further studies under field conditions are required to confirm their suitability for incorporation into integrated pest management strategies in the Peruvian Amazon.