Examinando por Materia "Lupinus mutabilis"

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Assessment of the genetic diversity and population structure of the peruvian andean legume, tarwi (Lupinus mutabilis), with high quality SNPs
(MDPI, 2023-03-16) Huaringa Joaquin, Amelia Wite; Saldaña Serrano, Carla Lizet; Saravia Navarro, David; García Bendezú, Sady; Rodriguez Grados, Pedro Manuel; Salazar Coronel, Wilian; Camarena Mayta, Felix; Injante Silva, Pedro Hugo; Arbizu Berrocal, Carlos Irvin
Lupinus mutabilis Sweet (Fabaceae), “tarwi” or “chocho”, is an important grain legume in the Andean region. In Peru, studies on tarwi have mainly focused on morphological features; however, they have not been molecularly characterized. Currently, it is possible to explore the genetic parameters of plants with reliable and modern methods such as genotyping by sequencing (GBS). Here, for the first time, we used single nucleotide polymorphism (SNP) markers to infer the genetic diversity and population structure of 89 accessions of tarwi from nine Andean regions of Peru. A total of 5922 SNPs distributed along all chromosomes of tarwi were identified. STRUCTURE analysis revealed that this crop is grouped into two clusters. A dendrogram was generated using the UPGMA clustering algorithm and, like the principal coordinate analysis (PCoA), it showed two groups that correspond to the geographic origin of the tarwi samples. AMOVA showed a reduced variation between clusters (7.59%) and indicated that variability within populations is 92.41%. Population divergence (Fst) between clusters 1 and 2 revealed low genetic difference (0.019). We also detected a negative Fis for both populations, demonstrating that, like other Lupinus species, tarwi also depends on cross-pollination. SNP markers were powerful and effective for the genotyping process in this germplasm. We hope that this information is the beginning of the path towards a modern genetic improvement and conservation strategies of this important Andean legume.
Catálogo de TARWI del Banco de Germoplasma del INIA
(Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA), 2026-03) Peña Elme, Eunice Corcas; Ortega Quispe, Kevin Abner; Girón Aguilar, Rita Carolina; Cerrón Mercado, Francis Gladys
El tarwi es una leguminosa andina con un alto valor nutricional, que destaca por su elevado contenido de proteínas y aceites (Guilengue et al., 2019). Su importancia radica en sus múltiples usos, que abarcan desde la alimentación humana y animal, hasta la mejora de suelos gracias a su capacidad para fijar nitrógeno (Parra-Gallardo et al., 2024). Debido a estas características, el tarwi se presenta como una alternativa estratégica para el fortalecimiento de la seguridad alimentaria (Tapia, 2015). En su centro de origen, en las zonas altoandinas, el tarwi ha sido una fuente primordial de proteínas para la nutrición humana durante más de 2000 años (Caligari et al., 2000), desde la época preincaica, especialmente en países como Perú, Bolivia y Ecuador (Rosell et al., 2009). A pesar de su larga historia de domesticación, su estudio y mejoramiento genético siguen siendo limitados (Bebeli et al., 2020). No obstante, en los últimos años, su potencial ha despertado un creciente interés en la investigación agronómica y el desarrollo de variedades mejoradas (Rodríguez-Ortega et al., 2023). En Perú, durante el año 2022, la producción alcanzó las 16 904 toneladas, con una superficie cosechada de 11 457 hectáreas y un rendimiento promedio de 1479 kg/ha. El 85 % de esta producción se concentró en los departamentos de La Libertad, Cusco, Apurímac, Puno y Huánuco (Ministerio de Desarrollo Agrario y Riego [MIDAGRI], 2022). Asimismo, en el año 2024 se registró un incremento significativo, alcanzando las 21 639 toneladas (MIDAGRI, 2024). La gran diversidad genética del tarwi refleja su capacidad de resiliencia frente a diversas condiciones ambientales, lo que ha facilitado su crecimiento en suelos pobres y ha permitido mantener su cultivo en áreas donde otras especies no prosperan (Gulisano et al., 2019). Esta diversidad ofrece un valioso recurso para los programas de mejoramiento genético, potenciando su uso comercial y facilitando su integración en nuevos sistemas de producción (Gulisano et al., 2022). Por ello, caracterizar la diversidad del tarwi es clave para su conservación y mejoramiento, ya que permite identificar accesiones con características agronómicas superiores, mayor tolerancia a factores bióticos y abióticos, y una mejor calidad nutricional. En este contexto, la Estación Experimental Agraria Santa Ana del INIA conserva una valiosa colección nacional de germoplasma de tarwi, con el propósito de proteger y mantener la diversidad genética de esta leguminosa andina, fundamental para la agricultura y la nutrición en nuestro país. Esta colección no solo resguarda el patrimonio genético del tarwi, además constituye un recurso estratégico para la investigación científica y la innovación tecnológica. El presente catálogo es el resultado del trabajo de caracterización agromorfológica de las accesiones que integran dicha colección y tiene como objetivo dar a conocer las características más destacadas de cada una de ellas, brindando información clave para estudios orientados al fitomejoramiento y a otras áreas del conocimiento.
Comparación de tres coeficientes de similitud para análisis con marcadores moleculares AFLP en Lupinus mutabilis Sweet
(Universidad Nacional de Tumbes, 2021-09-05) Aubert Carreño, Roberto F.; Quispe Flórez, Mercedes Maritza; Muñiz Durán, Griselda; Blas Sevillano, Raúl Humberto
Se utilizaron tres coeficientes de similitud: Simple Matching (SM), Jaccard (J) y Dice (D) para analizar la variabilidad genética mediante el uso de marcadores moleculares AFLP en 48 accesiones de Lupinus Mutabilis Sweet, 26 provenientes del Departamento de Cusco y 22 de departamentos y países distintos (Ecuador y Bolivia). A partir de matrices de similitud, se generaron dendrogramas con cada coeficiente, mediante el método UPGMA a través del software NTSYSpc versión 2.01, analizándose y comparándose entre sí, obteniendo un Coeficiente de correlación cofenética (r): SM=0,68674, J=0,79116 y D=0,79332; un Índice de consenso (Clc): SM–J=0,52, SM–D=0,52 y J–D=0,93; y niveles de similitud: SM=0,68, J=0,39 y D=0,56. Determinándose el coeficiente de Simple Matching como el más idóneo para análisis de variabilidad genética con marcadores dominantes como AFLP en L. mutabilis Sweet.
Genetic diversity and population structure of the Peruvian Andean legume, tarwi (Lupinus mutabilis), with high quality SNPs
(MDPI, 2023-01-19) Huaringa Joaquin, Amelia; Saldaña Serrano, Carla Lizet; Saravia Navarro, David; García Bendezú, Sady; Rodriguez Grados, Pedro; Salazar Coronel, Wilian; Camarena, Felix; Injante Silva, Pedro Hugo; Arbizu Berrocal, Carlos Irvin
Lupinus mutabilis Sweet (Fabaceae), “tarwi” or “chocho”, is an important grain legume in the Andean region. In Peru, studies on tarwi have mainly focused on morphological features; however, they have not been molecularly characterized. Currently, it is possible to explore the genetic parameters of plants with reliable and modern methods such as genotyping by sequencing (GBS). Here, for the first time, we used single nucleotide polymorphism (SNP) markers to infer the genetic diversity and population structure of 89 accessions of tarwi from nine Andean regions of Peru. A total of 5922 SNPs distributed along all chromosomes of tarwi were identified. STRUCTURE analysis revealed that this crop is grouped into two clusters. A dendrogram was generated using the UPGMA clustering algorithm and, like the principal coordinate analysis (PCoA), it showed two groups that correspond to the geographic origin of the tarwi samples. AMOVA showed a reduced variation between clusters (7.59%) and indicated that variability within populations is 92.41%. Population divergence (Fst) between clusters 1 and 2 revealed low genetic difference (0.019). We also detected a negative Fis for both populations, demonstrating that, like other Lupinus species, tarwi also depends on cross-pollination. SNP markers were powerful and effective for the genotyping process in this germplasm. We hope that this information is the beginning of the path towards a modern genetic improvement and conservation strategies of this important Andean legume.