Examinando por Materia "Clonación molecular"

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Clonación y filogenia molecular de un segmento del gen codante de la actina de Myrciaria dubia "camu camu": un candidato para gen de referencia
(Universidad Científica del Perú, 2012-12-28) Castro Gómez, Juan Carlos; Cobos Ruiz, Marianela; Egoavil Reátegui, Alina del Carmen; Ramírez Saavedra, Roberson; Imán Correa, Sixto Alfredo; Adrianzén Julca, Pedro Marcelino; Marapara del Aguila, Jorge Luis
[ES] Myrciaria dubia “camu-camu” es un frutal amazónico caracterizado por su amplia variación de vitamina C. Pero los estudios genético moleculares que puedan explicar esta variación son limitados. Por ello nuestro objetivo fue realizar la clonación y filogenia molecular de un segmento del gen codante de la actina de M. dubia. Las muestras fueron obtenidas de la colección de germoplasma del INIA. Luego, el ARN fue purificado y mediante RT-PCR con cebadores degenerados se amplificó un segmento del gen. En base a la secuencia obtenida se diseñaron cebadores específicos para PCR en tiempo real. Los resultados muestran que se ha aislado, clonado y secuenciado un segmento del gen codante de actina de M. dubia y detectado su expresión en hojas, pulpa y cáscara de M. dubia. Así, con el soporte de herramientas bioinformáticas y uso de técnicas de biología molecular hemos aislado, clonado y secuenciado un segmento del gen codante de la actina de M. dubia. Asimismo, los análisis realizados muestran que el gen se expresa y presenta niveles similares de expresión en hojas, pulpa y cáscara de M. dubia. Sin embargo, es necesario realizar más experimentos a fin de verificar su estabilidad de expresión. ---- [EN] Myrciaria dubia “camu-camu” is an amazonian fruit tree characterized for its ample variation in vitamin C. But molecular genetic studies that explains this variation are limited. Hence our objective was to accomplish cloning and molecular phylogeny of the segment of actin coding gene from M. dubia. The samples were obtained from germoplasma's collection of the INIA. Next, the ARN was purified and by RT-PCR with degenerate primers was amplified a segment of the gene. After, on the basis of the sequence obtained, specific primers were designed for real time PCR. Results showed that was isolated, cloned and sequenced a segment of actin gene coding from M. dubia. Thus with the support of bioinformatics tools and molecular biology techniques we have isolated, cloned and sequenced a segment of actin coding gene from M. dubia. Additionally, analyses showed that the gene have similar expression levels in leaves, pulp and peel from M. dubia. However, it is necessary to realize more experiments in order to verify its expression stability.
Dos nuevas variedades de papa (Solanum tuberosum spp andígena) con resistencia horizontal al tizon tardio, seleccionadas por las comunidades altoandinas del cusco, Perú a través de la selección varietal participativa
(Instituto Nacional de Innovación Agraria - INIA, 2010) Pacheco del Castillo, Miguel Ángel; Gastelo Benavides, Manuel Antonio; Landeo, Juan; Puente de la Vega, E.; Diaz, L.; De Haan, Stef
En la comunidad campesina de Chacllabamba ubicada en la vertiente oriental de los andes a 4100 msnm en el distrito de Challabamba, provincia de Paucartambo, departamento del Cusco en el Perú, el cultivo de las variedades nativas de papa es predominante, pero debido a los cambios climáticos que están afectando al planeta en los últimos años han perdido casi el 90 % de sus variedades nativas a causa del tizón tardío, enfermedad que anteriormente no era importante en la zona. Motivo por el cual el CIP en coordinación con el INIA, Ministerio de Agricultura envió 20 clones avanzados con resistencia al tizón tardío de B1C5 con el objetivo de ser evaluados y seleccionados bajo las condiciones locales, por los agricultores de esta comunidad usando la metodología de Selección varietal participativa dentro de un esquema acelerado de cuatro a cinco anos (CIP 2004).
Isolation and molecular cloning of genes from Myrciaria dubia “camu-camu” with potential use for biotechnological production of vitamin C
(Society for Biology and Biotechnology, 2016-11-03) Castro Gómez, Juan Carlos; Cobos Ruiz, Marianela; Maddox, J. Dylan; Imán Correa, Sixto Alfredo; Marapara del Aguila, Jorge Luis
Myrciaria dubia “camu-camu” is a rich source of several bioactive phytochemicals and vitamin C (L-ascorbic acid, AsA). To gain insights about the genes involved in AsA biosynthesis in this plant species and consequently with potential use for its biotechnological production, here we report the isolation and molecular cloning of partial gene sequences of the D-mannose/L-galactose pathway. Degenerate primers designed by the multiple sequence alignment of related plant species were used to isolate in M. dubia the partial sequences of the six D-mannose/L-galactose pathway genes (GMP, GME, GGP, GPP, GDH and GLDH). The deduced protein sequences of the six genes have more than 81% sequence identity to rosids and asterids species, with a closer phylogenetic relationship to Eucalyptus grandis. In conclusion, gene sequences of the D-mannose/L-galactose pathway involved in AsA biosynthesis of M. dubia were successfully isolated and cloned and the phylogenetic analysis indicated that these genes have been relatively well conserved throughout of plant evolution, reflecting the importance of the enzymes of this metabolic pathway for plant growth and survival. Additionally, the isolation and cloning of these genes allow us to implement systems for biotechnological production of AsA.
Nuevas variedades de papa Solanum tuberosum spp Andígena (B1C5), obtenidas a través de selección participativa por los agricultores del Altiplano de Puno - Perú
(Instituto Nacional de Innovación Agraria - INIA, 2010) Gastelo Benavides, Manuel Antonio; Arcos Pineda, Jesús; Landeo, Juan; Bonierbale, Merideth
La papa es el cultivo más importante en el Altiplano Peruano. Las variedades nativas ocupan la mayor área sembrada; sin embargo, algunos factores bióticos y abióticos son limitantes en su producción, originando bajos rendimientos y ocasionando que los agricultores tengan reducidos ingresos económicos disminuyendo así el nivel de vida de los pobladores andinos. El programa de Mejoramiento del CIP, ha desarrollado clones avanzados de papa derivados de variedades nativas de Solanum tuberosum spp andígena (B1C5), tratando de contribuir a la productividad agrícola y la reducción de la pobreza a través de la utilización sostenible de los recursos genéticos de la papa. Estos clones presentan características de resistencia horizontal al tizón tardío, precocidad, buena apariencia y altos rendimientos de tubérculos; manteniendo la diversidad de colores de piel, pulpa, alto contenido de materia seca y calidad para consumo en fresco. Estas cualidades les permiten competir ventajosamente con sus ancestros. Desde el año 2005 se viene evaluando un grupo de estos clones con participación directa de agricultores en diversas comunidades del Altiplano de Puno, con el objetivo de seleccionar clones promisorios adaptados a estas condiciones y que tengan alta productividad para convertirse en nuevas variedades de papa.
Selección y evaluación de nuevos clones de papas precoces con tolerancia a calor y resistencia a PVY
(Instituto Nacional de Innovación Agraria - INIA, 2010) Amoros Briones, Walter Rafael; Salas Murrugarra, Elisa del Carmen; Bonierbale, Merideth; Murga, R.
Desde sus inicios el Centro Internacional de la Papa (CIP) usando un vasto pool de genes contenido tanto en especies cultivadas como en silvestres ha generado una población altamente heterogénea y heretozigótica con resistencia a los virus mas importantes (PVY, PVX y PLRV) y adaptación a los trópicos y climas calidos (Mendoza y Estrada, 1977), a esta población se le denomina LTVR (de sus siglas en ingles lowland tropic virus resistant) que combina tolerancia a calor, precocidad y resistencia a virus (Bonierbale, et al 2009). En el mejoramiento de esta población se utiliza un esquema de selección fenotípica recurrente con selección de progenitores con prueba de progenie. El objetivo del mejoramiento del CIP esta enfocado en un mejoramiento de germoplasma con resistencia a las principales enfermedades (tizón tardío y virosis) y tolerancia a factores abióticos (calor y sequía). Este germoplasma es distribuido a los países en desarrollo y más pobres del mundo que mayormente se encuentra en la región tropical. Dada la necesidad de contar con materiales genéticos más precoces y tolerantes al calor que las variedades actuales, se ha generado un nuevo grupo de materiales con estas características.