Examinando por Materia "Amazonia peruana"

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Population structure and diversity of common bean (Phaseolus vulgaris L.) landraces in the Peruvian Amazon
(Public Library of Science (PLOS) — San Francisco, CA, Estados Unidos de América, 2026-07-20) Tobaru, Jorge; Barrera Lozano, Marvin; Vecco Giove, Carlos; Peláez, Jorge; Pinchi, Mack; Vargas, Yesenia; Chuquillanqui, Jorge; Soto Torres, Julian; Robles, Ronald; Saravia Navarro, David; Petroli, Cesar; Etchevers, Jorge; Ortiz, Rodomiro; Blas, Raul
Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is a globally important grain legume, yet the genetic diversity of landraces from the Peruvian Amazon remains poorly characterized. This study aimed to assess the population structure and genetic diversity of Amazonian common bean by integrating morphological and genome-wide SNP data. A total of 476 accessions were phenotyped using 18 morphological traits, and 647 accessions were genotyped with 23,050 high-quality DArTseq SNP markers. Cluster and population structure analyses consistently identified two major genetic groups corresponding to the Andean (n = 284) and Mesoamerican (n = 363) gene pools, with further subdivision into four subgroups at K = 4. Principal Coordinate Analysis supported this structure, with the first axis explaining 62.62% of the variation in the molecular data. Genetic diversity was high, with 94.9% of SNPs successfully mapped and more than 94% of loci polymorphic in both groups. However, observed heterozygosity was low (Ho = 0.035–0.041) compared to expected heterozygosity (He ≈ 0.147–0.148), and inbreeding coefficients were high (FIS = 0.52–0.54), consistent with the predominantly self-pollinating mating system. Hill number analyses indicated similar allelic richness between groups (q = 0: α ≈ 1.95–1.97) and low differentiation in allele presence (β = 1.04), whereas differentiation increased when allele frequencies were considered (q = 2: β ≈ 1.4–1.5). Morphological analyses revealed substantial phenotypic variation, including flowering time (32–75 days), pod length (6.5–17.3 cm), and number of locules per pod (2–11), and identified four distinct phenotypic clusters. No redundant accessions were detected. These results indicate that Amazonian landraces harbor high levels of genetic and phenotypic diversity structured by gene pool origin and local adaptation. The integration of morphological and SNP data provides a robust framework for germplasm characterization and highlights the importance of conserving these genetic resources for future breeding and sustainable agriculture.
Variabilidad fenotípica de accesiones de caupí Vigna unguiculata del Banco de Germoplasma del INIA
(Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología, 2026-05-19) León Mendoza, Luis Humberto; Castro Angulo, Raúl Ericson; Angulo Villacorta, Carlos Darwin; Campos Cedano, Johnny Carlos; Vásquez Inuma, Lady Liliana; Sangama Arirama, Misael Nemecio; Solano Vargas, Jhordy Janno; Martínez Zapata, Boris Guillermo
El caupí (Vigna unguiculata) es un cultivo transitorio adaptado a climas tropicales y subtropicales, importante para la seguridad alimentaria. En este contexto, el Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA) en 2021 implementó la colección de leguminosas tropicales para su propagación, conservación y estudio. Este estudio evaluó su variabilidad fenotípica e identificó accesiones promisorias mediante descriptores agromorfológicos. En 2022-2023 se evaluaron 23 accesiones con 10 descriptores (7 cuantitativos y 3 cualitativos); se detectó variación sólo en tres descriptores cuantitativos, y los cualitativos mostraron alta concordancia. En 2024 se evaluaron 26 descriptores (14 cualitativos, 12 cuantitativos), encontrándose diferencias significativas en todos los descriptores; los de mayor partición fueron peso de 100 semillas y tamaño del pedúnculo. El análisis multivariado de componentes explicó el 60,3 % de la varianza total, Dim1 separó principalmente los rasgos biométricos de la semilla y Dim2 la variación fenológica. Los índices de Shannon-Weaver y Gini-Simpson evidenciaron que el patrón del hilio, textura de la testa, forma de la semilla, color del hilio y pigmentación de la vaina inmadura presentaron mayor capacidad discriminante y diversidad. Se seleccionaron accesiones promisorias con registro PER, valores superiores en el número de vainas por planta, tamaño de la vaina, número de lóculos por vaina y peso de 100 semillas, así como, el hábito de crecimiento y patrón de crecimiento compatibles con el destino de uso (consumo humano o forraje verde). Con base en estos criterios, se seleccionaron accesiones promisorias para consumo humano (PER1005854 y PER1005858) y para forraje/cobertura (PER1005851, PER1005852, PER1005853 y PER1005857).