Examinando por Autor "Cobos, Marianela"

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Caracterización molecular de Heliconia sp. utilizando la técnica RAPD
(Centro de Preparación para la Ciencia y Tecnología, 2019-01-14) Gutierrez, Freddy; Ramirez, Roberson; Adrianzén Julca, Pedro Marcelino; Cobos, Marianela; Pinedo Freyre, Sergio Fernando; Imán Correa, Sixto Alfredo; Castro, Juan
Este trabajo se realizó entre los meses de Julio a Setiembre del 2010, con el objetivo de caracterizar molecularmente a la especie Heliconia sp. Utilizando el marcador molecular RAPD. Para esto, se realizó la purificación del ADN genómico de la especie en estudio obteniéndose buenos resultados en cuanto a la calidad y la cantidad del ADN purificado, el cual fue verificado con los métodos electroforético y espectrofotométrico, la cantidad de ADN obtenido en promedio fue de 92.8 ng/ μl, asimismo el ratio de calidad promedio fue de 2.2. Para la amplificación de los productos de la PCR se empleó el iniciador MT3R, obteniéndose mucho polimorfismo. Los productos de la PCR tuvieron tamaños de 750 pb hasta 2050 pb. En cuanto a la caracterización molecular, se realizó un dendograma (UPGMA) utilizando el programa estadístico NTSIS versión 2.0. Asimismo se obtuvo la formación de 2 grupos (clusters) y 2 fugas donde se observó la aparición de “aparentes duplicados” en algunos de ellos, es decir, que comparten el mismo patrón genético con un 100% de similitud. Además el valor de la heterocigosidad esperada fue de 0.14, valor relativamente bajo, posiblemente al tipo de reproducción que posee este género, el cual es la autogamica.
Development and application of microsatellite markers for genetic diversity assessment and construction of a core collection of Myrciaria dubia (Kunth) Mcvaugh germplasm from the peruvian Amazon
(MDPI, 2024-10-25) Castro, Juan C.; Vasquez Guizado, Stalin Juan; Vigil Santillan, Bianca Estefani; Ascue, Francisco; Rojas Villa, Naysha; Paredes, Jae D.; Cobos, Marianela; Castro, Carlos G.; Motta, Daniel E.; Adrianzén, Pedro M.; Imán Correa, Sixto Alfredo; Maddox, J. Dylan
The Amazonian shrub Myrciaria dubia (camu-camu) produces vitamin C-rich fruits of growing commercial interest. However, sustainable utilization requires assessment and protection of the genetic diversity of the available germplasm. This study aimed to develop and apply microsatellite markers to assess genetic diversity and construct a core collection of M. dubia germplasm from the Peruvian Amazon. Sixteen polymorphic microsatellite loci were developed using an enrichment approach. The evaluation of 336 genotypes from 43 accessions of the germplasm bank, originating from eight river basins, was conducted using these newly developed markers. Genetic diversity parameters, including observed and expected heterozygosity, were calculated. Analysis of molecular variance (AMOVA) was performed to assess the distribution of genetic variation within and among accessions and river basins. Bayesian clustering analysis was employed to infer population structure. A core collection was constructed to maximize allelic richness. High genetic diversity was observed, with heterozygosity values ranging from 0.468 to 0.644 (observed) and 0.684 to 0.817 (expected) at the river basin level. AMOVA indicated significant genetic variation within (73–86%) compared to among (14–27%) accessions and river basins. Bayesian clustering detected ten genetic clusters, with several degrees of admixture among river basins, except for the genetically homogeneous Putumayo River basin. A core collection comprising 84 plant genotypes (25% of the full collection) was established, representing 90.82% of the overall allelic diversity. These results have important implications for M. dubia conservation strategies and breeding programs, in demonstrating a need for genetic connectivity between populations but preserving unique genetic resources in isolated basins. These results validate the expected levels of diversity and population subdivision in a crop and stress the need to secure genetically diverse germplasms, underscoring the importance of thorough genetic characterization for ex situ germplasm management.